Од почетка пандемије, дијагностичко тестирање има виталну улогу у контроли ширења САРС-ЦоВ-2, вируса који изазиваCOVID-19.Брзи тестови на антигенкоји се изводе код куће или у клиничком окружењу дају резултате за 15 минута или мање.Што се раније дијагностикује особа, то пре може тражити медицинску помоћ и изоловати се од других.Али када се појаве нове варијанте вируса, ове варијанте можда неће бити откривене овим тестовима.
Већина брзих тестова на антиген је дизајнирана за откривање САРС-ЦоВ-2 нуклеокапсидног протеина или Н-протеина.Овај протеин се налази у изобиљу у вирусним честицама и зараженим људима.Комплет за брзи тестс обично садрже два различита дијагностичка антитела која се везују за различите делове Н протеина.Када се антитело веже за Н протеин у узорку, на комплету за тестирање се појављује обојена линија или други сигнал, што указује на инфекцију.
Протеин Н се састоји од 419 структурних јединица аминокиселина.Било која од њих може бити замењена другом амино киселином мутацијом.Истраживачка група коју води др.Филип Франк и Ерик Ортлунд са Универзитета Емори су кренули да истраже како ова промена једне аминокиселине утиче на перформансе брзог теста на антиген.Користили су технику названу скенирање дубоких мутација да би истовремено проценили како свака мутација у Н протеину вируса утиче на везивање за дијагностичко антитело.Њихови резултати објављени су у Целл 15. септембра 2022.
Истраживачи су створили свеобухватну библиотеку од скоро 8.000 мутација Н протеина.Ове варијанте чине више од 99,5% свих могућих мутација.Затим су проценили како је свака варијанта интераговала са 17 различитих дијагностичких антитела коришћених у 11 комерцијално доступних брзих тестова на антиген, укључујући уобичајенекућни комплети.
Тим је проценио које мутације Н-протеина утичу на препознавање антитела.На основу ових информација, направили су „профил мутације бекства“ за свако дијагностичко антитело.Овај профил идентификује специфичне мутације у Н протеину које могу утицати на способност антитела да се веже за своју мету.Анализа је показала да антитела која се користе у данашњим брзим тестовима препознају и везују све претходне и садашње варијанте САРС-ЦоВ-2 које изазивају забринутост и забринутост.
Иако неколико дијагностичких антитела препознаје исти регион Н протеина, истраживачи су открили да свако антитело има јединствени потпис мутација које излазе.Како вирус САРС-ЦоВ-2 наставља да мутира и генерише нове варијанте, ови подаци се могу користити за означавање антитела из комплета за тестирање која ће можда морати да се поново процене.
„Тачна и ефикасна идентификација заражених особа остаје критична стратегија за ублажавање ЦОВИД-19, а наша студија пружа информације о будућим мутацијама САРС-ЦоВ-2 које би могле да ометају откривање“, рекао је Ортлунд.„Резултати који су овде наведени омогућавају нам да се брзо прилагодимо овом вирусу како се нове варијанте настављају појављивати, што представља непосредне клиничке и последице по јавно здравље.
Позадина: Дубинско скенирање мутације открива мутације које побегну у нуклеокапсиду САРС-ЦоВ-2 користећи тренутно доступне брзе тестове на антиген.Франк Ф., Кин ММ, Рао А., Бассит Л., Лиу Х, Боверс ХБ, Пател АБ, Като МЛ, Сулливан ЈА, Греенлеаф М., Пиантадоси А., Лам ВА, Худсон ВХ, Ортлунд ЕА ћелија.2022. 15. септембар;185(19):3603-3616.е13.Министарство унутрашњих послова: 10.1016/ј.целл.2022.08.010.29. август 2022. ПМИД: 36084631.
Финансирање: Национални институт за биомедицинско снимање и биоинжењеринг НИХ (НИБИБ), Национални институт за дијабетес, дигестивне и бубрежне болести (НИДДК) и Национални институт за алергије и инфективне болести (НИАИД), Америчко удружење за срце.
НИХ Ресеарцх Маттерс је недељно ажурирање кључних налаза истраживања НИХ-а које су прегледали стручњаци НИХ-а.Објављује га Канцеларија за комуникације и односе са јавношћу директора Националног института за здравље.